MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus bourgensis MS2

Total Repeats: 53393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018227	CAT	2	6	424	429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
2	NC_018227	GCCC	2	8	583	590	0 %	0 %	25 %	75 %	397779167
3	NC_018227	CAA	2	6	592	597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397779167
4	NC_018227	CGGGA	2	10	634	643	20 %	0 %	60 %	20 %	397779167
5	NC_018227	GC	3	6	690	695	0 %	0 %	50 %	50 %	397779167
6	NC_018227	GATA	2	8	739	746	50 %	25 %	25 %	0 %	397779167
7	NC_018227	CGA	2	6	784	789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
8	NC_018227	CCGA	2	8	845	852	25 %	0 %	25 %	50 %	397779167
9	NC_018227	TCA	2	6	906	911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
10	NC_018227	CGA	2	6	916	921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
11	NC_018227	AAG	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397779167
12	NC_018227	GCG	2	6	945	950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779167
13	NC_018227	CT	3	6	957	962	0 %	50 %	0 %	50 %	397779167
14	NC_018227	CAT	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
15	NC_018227	TCCTC	2	10	1062	1071	0 %	40 %	0 %	60 %	397779167
16	NC_018227	AGG	2	6	1080	1085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779167
17	NC_018227	TCCC	2	8	1095	1102	0 %	25 %	0 %	75 %	397779167
18	NC_018227	CAG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
19	NC_018227	AG	3	6	1137	1142	50 %	0 %	50 %	0 %	397779167
20	NC_018227	GCG	2	6	1196	1201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779167
21	NC_018227	AGG	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779167
22	NC_018227	TCC	2	6	1245	1250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779167
23	NC_018227	TGG	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779167
24	NC_018227	GGT	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779167
25	NC_018227	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
26	NC_018227	CCG	2	6	1501	1506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779167
27	NC_018227	TCA	2	6	1545	1550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
28	NC_018227	GTC	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779167
29	NC_018227	CGA	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
30	NC_018227	CAAG	2	8	1614	1621	50 %	0 %	25 %	25 %	397779167
31	NC_018227	GAG	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779167
32	NC_018227	TCA	2	6	1632	1637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779167
33	NC_018227	CGA	2	6	1654	1659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779167
34	NC_018227	TCC	3	9	1735	1743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779168
35	NC_018227	GCT	2	6	1745	1750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779168
36	NC_018227	GGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779168
37	NC_018227	CAG	2	6	1829	1834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779168
38	NC_018227	GGC	2	6	1841	1846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779168
39	NC_018227	CCG	2	6	1856	1861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779168
40	NC_018227	CGG	2	6	1867	1872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779168
41	NC_018227	TCG	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779168
42	NC_018227	GGCA	2	8	1889	1896	25 %	0 %	50 %	25 %	397779168
43	NC_018227	GATCG	2	10	1956	1965	20 %	20 %	40 %	20 %	397779168
44	NC_018227	TGA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397779168
45	NC_018227	CTG	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779168
46	NC_018227	GCAT	2	8	2053	2060	25 %	25 %	25 %	25 %	397779168
47	NC_018227	ATC	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779168
48	NC_018227	TGAGG	2	10	2205	2214	20 %	20 %	60 %	0 %	397779168
49	NC_018227	TCC	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779169
50	NC_018227	TTC	2	6	2276	2281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397779169
51	NC_018227	GGA	2	6	2299	2304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779169
52	NC_018227	GAG	2	6	2486	2491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779169
53	NC_018227	ATC	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779169
54	NC_018227	GCG	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
55	NC_018227	GGC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
56	NC_018227	TGT	2	6	2542	2547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397779169
57	NC_018227	CGA	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779169
58	NC_018227	TCGC	2	8	2609	2616	0 %	25 %	25 %	50 %	397779169
59	NC_018227	CGG	2	6	2617	2622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
60	NC_018227	CGG	2	6	2743	2748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
61	NC_018227	AGG	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779169
62	NC_018227	CCT	2	6	2785	2790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779169
63	NC_018227	CCT	2	6	2803	2808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779169
64	NC_018227	CGA	2	6	2818	2823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779169
65	NC_018227	CGG	2	6	2865	2870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
66	NC_018227	GC	3	6	2958	2963	0 %	0 %	50 %	50 %	397779169
67	NC_018227	CGG	2	6	2979	2984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
68	NC_018227	CCA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397779169
69	NC_018227	GCG	2	6	3038	3043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779169
70	NC_018227	TCG	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779169
71	NC_018227	AAAC	2	8	3130	3137	75 %	0 %	0 %	25 %	397779169
72	NC_018227	CTC	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779169
73	NC_018227	AGC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779169
74	NC_018227	GTC	2	6	3254	3259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779169
75	NC_018227	AAG	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397779169
76	NC_018227	CGG	2	6	4986	4991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779171
77	NC_018227	C	6	6	5005	5010	0 %	0 %	0 %	100 %	397779171
78	NC_018227	GCG	2	6	5020	5025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779171
79	NC_018227	TAT	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397779170
80	NC_018227	CGG	2	6	5155	5160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779170
81	NC_018227	CCAT	2	8	5219	5226	25 %	25 %	0 %	50 %	397779170
82	NC_018227	GCG	2	6	5238	5243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779170
83	NC_018227	GCG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779170
84	NC_018227	TCG	2	6	5358	5363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779170
85	NC_018227	AGG	2	6	5382	5387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779170
86	NC_018227	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779170
87	NC_018227	GCGGT	2	10	5428	5437	0 %	20 %	60 %	20 %	397779170
88	NC_018227	AAG	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397779170
89	NC_018227	GGCA	2	8	5556	5563	25 %	0 %	50 %	25 %	397779170
90	NC_018227	ACG	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779170
91	NC_018227	GTG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779170
92	NC_018227	CTC	2	6	5645	5650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779170
93	NC_018227	CGC	2	6	5734	5739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779170
94	NC_018227	CGA	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779170
95	NC_018227	TCG	2	6	5778	5783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779170
96	NC_018227	GAG	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779170
97	NC_018227	CCG	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779170
98	NC_018227	GAT	2	6	5941	5946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397779170
99	NC_018227	ATC	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779170
100	NC_018227	CTG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779172
101	NC_018227	CTG	3	9	6193	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779172
102	NC_018227	GAG	2	6	6223	6228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779172
103	NC_018227	CCT	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779172
104	NC_018227	CCG	2	6	6356	6361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779173
105	NC_018227	ATC	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779173
106	NC_018227	CAA	2	6	6469	6474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397779173
107	NC_018227	CTC	2	6	6476	6481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779173
108	NC_018227	T	6	6	6494	6499	0 %	100 %	0 %	0 %	397779173
109	NC_018227	TCT	2	6	6571	6576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397779173
110	NC_018227	GCGG	2	8	6638	6645	0 %	0 %	75 %	25 %	397779173
111	NC_018227	CGG	2	6	6676	6681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779173
112	NC_018227	CGG	2	6	6691	6696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779173
113	NC_018227	TCC	2	6	6699	6704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779173
114	NC_018227	TCC	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779173
115	NC_018227	CGC	2	6	6797	6802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779173
116	NC_018227	CGC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779174
117	NC_018227	GCT	2	6	6871	6876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779174
118	NC_018227	CTC	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779174
119	NC_018227	GTG	2	6	6946	6951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779174
120	NC_018227	CCGG	2	8	6971	6978	0 %	0 %	50 %	50 %	397779174
121	NC_018227	CGC	2	6	7030	7035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779174
122	NC_018227	TACCTC	2	12	7070	7081	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397779174
123	NC_018227	CTC	3	9	7094	7102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397779174
124	NC_018227	GCCTG	2	10	7110	7119	0 %	20 %	40 %	40 %	397779174
125	NC_018227	GAG	2	6	7130	7135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397779174
126	NC_018227	CGG	2	6	7143	7148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779174
127	NC_018227	CGG	2	6	7168	7173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779174
128	NC_018227	TGG	2	6	7203	7208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779174
129	NC_018227	GCC	2	6	7253	7258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397779174
130	NC_018227	TGG	2	6	7281	7286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397779174
131	NC_018227	CAT	2	6	7291	7296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779174
132	NC_018227	TTC	2	6	7319	7324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397779174
133	NC_018227	CGG	2	6	7338	7343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779174
134	NC_018227	CGGT	2	8	7349	7356	0 %	25 %	50 %	25 %	397779174
135	NC_018227	GATGC	2	10	7367	7376	20 %	20 %	40 %	20 %	397779174
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137	NC_018227	GAC	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397779174
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149	NC_018227	CGG	2	6	7830	7835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397779175
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165	NC_018227	TCG	2	6	8321	8326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397779175
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257	NC_018227	ATC	2	6	13155	13160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397779183
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